差價關稅也是歐盟對從非成員國進口的農產品征收的一種進口關稅。其稅額是歐盟所規定的門檻價格與實際進口的貨價加運保費（CIF）之間的差額。門檻價格是歐盟根據歐盟境內谷物最短缺地區公開市場上可能出售的價格（境內谷物最高價格）減去從進境地到達該地區市場的運費、保險費、雜費和銷售費用后所規定的價格。門檻價格是計算差價稅的基準價格，外國農產品抵達歐盟港口（地）的CIF價格低于此價時，即按其差額征稅，使稅后的外國農產品進入歐盟的市場價格不低于歐盟同類產品的價格。征收差價稅是歐盟實施共同農業政策的一項主要措施。其主要目的是為了保護和促進歐盟內部的農業生產。所征差價稅款作為農業發展資金，用于資助和扶持內部農業生產的發展。征收差價稅的農產品包括糧食及其制品；生豬、豬肉、家禽、蛋、動植物油、脂、奶制品、糖、食糖及糖漿等農畜產品及其制品。對使用部分農產品加工成的制成品．除按進口稅則征收工業品的進口稅外，還對其所含農產品部分另征部分差價稅。在歐共體成立之初，各成員國之間的農產品貿易也曾使用過差價稅，使其各成員國的農產品價格逐步拉平。1968年取消了內部的差價稅，建立了統一的農產品市場。歐盟的共同農業政策，使歐盟成員國成為世界農產品的重要產地和出口地。
征收差價關稅的目的與方法
征收差價關稅其目的是：通過征收差價稅，拉平進口商品與國產商品的價格，使該種進口商品的稅后價格保持在一個預定的價格標準上，以穩定進口國內該種商品的市場價格，保護國內生產。由于國內外同種商品的價格時常變動，它們之間的價格差額也會因之產生波動，因此差價稅是一種滑動關稅（Sliding Duty）。
各國征收差價稅的具體辦法也不盡相同，有的規定按價格差額征收；有的規定在征收正常進口稅后另行征收——實際上屬于一種進口附加稅，又稱為附加差額稅。歐盟為保護其農畜產品免受非成員國低價農產品競爭，而對進口的農產品征收差價稅。歐盟首先在共同市場內部按生產效率最低而價格最高的內地中心市場的價格為準，制訂統一的目標價格（Target Price），然后在目標價格中扣除從進境地運到內地中心市場的運費、保險費、雜費和銷售費用后，得到門檻價格（Threshold Price）；如果外國農產品抵達歐盟進境地的到岸價格低于門檻價格，則按其間差額確定差價稅率。差價稅實際上歐盟實現共同農業政策的一項重要措施。
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