通常情況下，二者之間的區別主要體現在以下幾個方面：
（1）適用稅率不同。小規模納稅人適用3%征收率，而一般納稅人則適用13%、9%、6%、0幾檔稅率。
（2）記賬報稅要求不同。
當前，我國對于小規模納稅人記賬報稅管理相對寬松，但對于一般納稅人來說，則要求相對較高。
小規模納稅人應交稅金計算是按照銷售額乘以增值稅稅率計算，而一般納稅人則是按照銷項稅額和進項稅額的差額納稅。
（3）申報周期不同。小規模納稅人可自行選擇以月度或季度為納稅周期來申報納稅，
而一般納稅人通常是以月度為單位來進行納稅申報。